Admixture as a source for HLA variation in Neolithic European farming communities

Haak W, Balanovsky O, Sanchez JJ, Koshel S, Zaporozhchenko V, Adler CJ, et al. Ancient DNA from European Early Neolithic Farmers Reveals Their Near Eastern Affinities. PLoS Biol. 2010;8:e1000536.

Article  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Marchi N, Winkelbach L, Schulz I, Brami M, Hofmanová Z, Blöcher J, et al. The genomic origins of the world’s first farmers. Cell. 2022;185:1842-59.e18.

Article  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Brandt G, Haak W, Adler CJ, Roth C, Szecsenyi-Nagy A, Karimnia S, et al. Ancient DNA Reveals Key Stages in the Formation of Central European Mitochondrial Genetic Diversity. Science. 2013;342:257–61.

Article  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Lipson M, Szécsényi-Nagy A, Mallick S, Pósa A, Stégmár B, Keerl V, et al. Parallel palaeogenomic transects reveal complex genetic history of early European farmers. Nature. 2017;551:368–72.

Article  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Haak W, Lazaridis I, Patterson N, Rohland N, Mallick S, Llamas B, et al. Massive migration from the steppe was a source for Indo-European languages in Europe. Nature. 2015;522:207–11.

Article  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Immel A, Pierini F, Rinne C, Meadows J, Barquera R, Szolek A, et al. Genome-wide study of a Neolithic Wartberg grave community reveals distinct HLA variation and hunter-gatherer ancestry. Commun Biol. 2021;4:113.

Article  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Drummer C. Vom Kollektiv zum Individuum: Transformationsprozesse am Übergang vom 4. zum 3. Jahrtausend v. Chr. in der deutschen Mittelgebirgszone. Leiden: Sidestone Press; 2022.

Raetzel-Fabian D. Absolute Chronology and Cultural Development of the Neolithic Wartberg Culture in Germany. J Neolit Archaeol. 2002;4:1–11.

Brandt DYC, César J, Goudet J, Meyer D. The Effect of Balancing Selection on Population Differentiation: A Study with HLA Genes. G3 GenesGenomesGenetics. 2018;8:2805–15.

Article  CAS  Google Scholar 

Radwan J, Babik W, Kaufman J, Lenz TL, Winternitz J. Advances in the Evolutionary Understanding of MHC Polymorphism. Trends Genet. 2020;36:298–311.

Article  CAS  PubMed  Google Scholar 

Solberg OD, Mack SJ, Lancaster AK, Single RM, Tsai Y, Sanchez-Mazas A, et al. Balancing selection and heterogeneity across the classical human leukocyte antigen loci: A meta-analytic review of 497 population studies. Hum Immunol. 2008;69:443–64.

Article  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Davy T, Ju D, Mathieson I, Skoglund P. Hunter-gatherer admixture facilitated natural selection in Neolithic European farmers. Curr Biol. 2023;33:1365-71.e3.

Article  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Irving-Pease EK, Refoyo-Martínez A, Barrie W, Ingason A, Pearson A, Fischer A, et al. The selection landscape and genetic legacy of ancient Eurasians. Nature. 2024;625:312–20.

Article  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Barrie W, Yang Y, Irving-Pease EK, Attfield KE, Scorrano G, Jensen LT, et al. Elevated genetic risk for multiple sclerosis emerged in steppe pastoralist populations. Nature. 2024;625:321–8.

Article  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Childebayeva A, Rohrlach AB, Barquera R, Rivollat M, Aron F, Szolek A, et al. Population Genetics and Signatures of Selection in Early Neolithic European Farmers. Mol Biol Evol. 2022;39:msac108.

Article  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Rivollat M, Rohrlach AB, Ringbauer H, Childebayeva A, Mendisco F, Barquera R, et al. Extensive pedigrees reveal the social organization of a Neolithic community. Nature. 2023;620:600–6.

Article  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Biel J. Ein bandkeramischer Friedhof in Fellbach-Oeffingen, Rems-Murr-Kreis. In: Süsskind G, editor. Archäologische Ausgrabungen in Baden-Württemberg 1987. Stuttgart: Theiss; 1988. p. 38–40.

Google Scholar 

Trautmann I, Wahl J. Leichenbrände aus linearbandkeramischen Gräberfeldern Südwestdeutschlands - Zum Bestattungsbrauch in Schwetzingen und Fellbach-Oeffingen. In: Landesamt für Denkmalpflege Stuttgart. Fundberichte aus Baden-Württemberg. Stuttgart: Theiss; 2020; p. 7–18.

Pechtl J, Hanöffner S, Staskiewicz A, Obermaier H. Die linienbandkeramische Gräbergruppe von Niederpöring-"Leitensiedlung", Gde. Oberpöring, Lkr. Deggendorf. In: Husty L, Schmotz K, editors. Vorträge des 36. Niederbayerischen Archäologentages. Rahden/Westf.: M. Leidorf; 2018. p. 29–84.

Biermann E. Großgartach und Oberlauterbach: Interregionale Beziehungen im süddeutschen Mittelneolithikum. Bonn: Habelt; 1997.

Google Scholar 

Dürrwächter C, Craig O, Taylor G, Collins M, Burger J, Alt KW. Ernährungsrekonstruktion in neolithischen Populationen anhand der Analyse stabiler Isotope: Trebur (HST/GG) und Herxheim (späte LBK). Berichte der Kommission für Archäologische Landesforschung in Hessen. 2003;7:43–53.

Google Scholar 

Falkenstein F. Geschlechterrollen und Sozialstatus im Spiegel der neolithischen Gräberfelder von Aiterhofen-Ödmühle und Trebur. In: Falkenstein F, Schade-Lindig S, Zeeb-Lanz A, editors. Kumpf, Kalotte, Pfeilschaftglätter. Zwei Leben für die Archäologie. Gedenkschrift für Annemarie Häußer und Helmut Spatz. Internationale Archäologie - Studia honoraria 27. Rahden/Westf.: VML; 2008. p. 77–95.

Kunter M. Beobachtungen zur Frage der Bevölkerungskontinuität an dem mittelneolithischen Gräberfeld von Trebur, Südhessen. In: Lippert A, Schultz M, Shennan S, Teschler-Nicola M, editors. Mensch und Umwelt während des Spätneolithikums und der Frühbronzezeit in Mitteleuropa. Rahden/Westf.: M. Leidorf; 2001. p. 203–206.

Teegen WR, Kreutz K, Kunter M. Die Menschen aus Trebur. In: Heide B, editor. Leben und Sterben in der Steinzeit. Ausstellung im Landesmuseum Mainz, 22. Juni - 21. September 2003. Mainz: Zabern; 2003. p. 127–130.

Teegen, WR, Kreutz K, Kunter M. Neue paläopathologische Beobachtungen an Skeletten aus dem mittelneolithischen Gräberfeld von Trebur (Ldkr. Groß-Gerau): ein Vorbericht. In: Benecke N, Döhle, H-J, editors. Beiträge zur Archäozoologie und prähistorischen Anthropologie 4. Konstanz: Gesellschaft für Archäozoologie und Prähistorische Anthropologie; 2003. p. 46–50.

Spatz H. Das mittelneolithische Gräberfeld von Trebur, Kreis Gross-Gerau. Wiesbaden: Landesamtes für Denkmalpflege Hessen; 1999.

Google Scholar 

Müller J. Zur Belegungsabfolge des Gräberfeldes von Trebur: Argumente der typologieunabhängigen Datierungen. Praehistorische Zeitschrift. 2002;77:148–58.

Article  Google Scholar 

Drummer C. Grabhandlungen oder Handlungen am Grab? Die Bedeutung schnurkeramischer Scherben und unterschiedlicher Bestattungskonzepte am Beispiel des Galeriegrabes Altendorf, Lkr. Kassel. In: Balkowski N, Hofmann KP, Hohle IA, Schülke A, editors. Mensch – Körper – Tod. Der Umgang mit menschlichen Überresten im Neolithikum Mitteleuropas. Leiden: Sidestone Press; 2023. p. 267–288.

Jordan W. Das Steinkammergrab von Altendorf, Kr. Wolfhagen. Kurhessische Bodenaltertümer 3. Elwert; 1954. p. 5–26.

Pape EA. Shared Ideology of Death? The architectural elements and the uses of the Late Neolithic gallery graves of Western Germany and the Paris Basin. Bonn: Habelt; 2019.

Google Scholar 

Schierhold K. Studien Zur Hessisch-Westfälischen Megalithik: Forschungsstand und -perspektiven im europäischen Kontext. Rahden/Westf.: M. Leidorf; 2012.

Rinne C, Drummer C, Hamann C. Collective and individual burial practices. Changing patterns at the beginning of the third millennium BC: The megalithic grave of Altendorf. J Neolit Archaeol; 2019. p. 75–88.

Google Scholar 

Raetzel-Fabian D. Absolute Chronologie. In: Günther K, editor. Die Kollektivgräber-Nekropole Warburg I-V. Bodenaltertüm Westfalens 34. Mainz: Zabern; 1997. p. 165–78.

Günther K. Ein Großsteingrab in der Warburger Börde bei Hohenwepel, Stadt Warburg, Kr. Höxter Ausgrabungen und Funde in Westfalen-Lippe. 1986;4:65–97.

Google Scholar 

Günther K. Neolithische Bildzeichen an einem ehemaligen Megalithgrab bei Warburg, Kreis Höxter (Westfalen). Germania 68. Mainz: Zabern; 1990. p. 39–65.

Günther K. Ein jungneolithisches Kammergrab bei Warburg, Kreis Höxter, Westfalen. Arch. Korrbl. 21. Mainz: Verlag des Römisch-Germanischen Zentralmuseums; 1991. p. 215–222.

Günther K. Die Kollektivgräber-Nekropole Warburg I-V. Mainz: Zabern; 1997.

Google Scholar 

Pollmann HO. Die Galeriegräber von Warburg. Die Skelette aus der Galeriegrab-Nekropole von Warburg und aufgehende Steinmauern in der Siedlung von Warburg-Menne. In: Otten T, Kunow J, Rind MM, Trier M, editors. Revolution Jungsteinzeit: archäologische Landesausstellung Nordrhein-Westfalen: Begleitkatalog zur Ausstellung im LVR-Landesmuseum Bonn vom 5.9. 2015–3.4.2016. Darmstadt: Theiss; 2015. p. 395–398.

Schierhold K. Landscape between cultures: Westphalia between 4100 and 2700 BC. In: Furholt M, Hinz M, Mischka D, Noble G, Olausson D, editors. Landscapes, Histories and Societies in the Northern European Neolithic. Bonn: Habelt; 2014. p. 145–54.

Google Scholar 

Raetzel-Fabian D. Der nordwestliche Nachbar: Neue Aspekte zur Wartbergkultur. In: Harri Gohlisch T, Reisch L, editors. Die Stellung der endneolithischen Chamer Kultur in ihrem räumlichen und zeitlichen Kontext: Erlangen 26.-28.3.1999. Erlangen: Institut für Ur- und Frühgeschichte; 2001. p. 107–19.

Google Scholar 

Glüsing P. Eine Siedlung der spätneolithischen Galeriegrabkultur im Weißen Holz bei Warburg-Rimbeck, Kr. Höxter. Ausgrabungen und Funde in Westfalen-Lippe. 1984;2:17–21.

Google Scholar 

Günther K, Archäologische und geophysikalische Arbeiten des Jahres 1985 am jungsteinzeitlichen Erdwerk Rimbeck, Stadt Warburg, Kreis Höxter. Ausgrabungen und Funde in Westfalen-Lippe. 1985;5(1987):1–7.

Google Scholar 

Knoche B. Das Jungsteinzeitliche Erdwerk von Rimbeck bei Warburg, Kreis Höxter. Münster: Altertumskommision für Westfalen; 2003.

Google Scholar 

Dammers B, Das Gräberfeld von Trebur. In: Heide B, editor. Leben und Sterben in der Steinzeit. Zabern: Mainz; 2003. p. 121–6.

Spatz H. Beiträge zum Kulturenkomplex Hinkelstein - Großgartach - Rössen: der keramische Fundstoff des Mittelneolithikums aus dem mittleren Neckarland und seine zeitliche Gliederung. Stuttgart: K. Theiss; 1996.

Google Scholar 

Szécsényi-Nagy A, Brandt G, Haak W, Keerl V, Jakucs J, Möller-Rieker S, et al. Tracing the genetic origin of Europe’s first farmers reveals insights into their social organization. Proc R Soc B Biol Sci. 2015;282:20150339.

Article  Google Scholar 

Olalde I, Schroeder H, Sandoval-Velasco M, Vinner L, Lobón I, Ramirez O, et al. A Common Genetic Origin for Early Farmers from Mediterranean Cardial and Central European LBK Cultures. Mol Biol Evol. 2015;32:3132–42.

CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Posth C, Yu H, Ghalichi A, Rougier H, Crevecoeur I, Huang Y, et al. Palaeogenomics of Upper Palaeolithic to Neolithic European hunter-gatherers. Nature. 2023;615:117–26.

Article  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Ringbauer H, Novembre J, Steinrücken M. Parental relatedness through time revealed by runs of homozygosity in ancient DNA. Nat Commun. 2021;12:5425.

Article  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

Seitz S, Lange V, Norman PJ, Sauter J, Schmidt AH. Estimating HLA haplotype frequencies from homozygous individuals – A Technical Report. Int J Immunogenet. 2021;48:490–5.

Article  CAS  PubMed 

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